Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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TUBB3Q13509 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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TUBB3Q13509 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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TUBB3Q13509 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBB3Q13509 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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