Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPM6BQ13491 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPM6BQ13491 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms