Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TCIRG1Q13488 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCIRG1Q13488 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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