Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MKRN4PQ13434 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MKRN4PQ13434 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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