Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF5Q13243 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRSF5Q13243 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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