Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPRL3Q12980 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NPRL3Q12980 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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