Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF1Q10570 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF1Q10570 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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