Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN5Q08AF3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN5Q08AF3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms