Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC1Q08554 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms