Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms