Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC3A1Q07837 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC3A1Q07837 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms