Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABPAQ06546 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms