Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN12Q05209 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN12Q05209 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms