Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms