Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL7P80098 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL7P80098 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL7P80098 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL7P80098 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL7P80098 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL7P80098 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms