Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS29P62273 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS29P62273 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS29P62273 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RPS29P62273 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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