Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARF3P61204 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARF3P61204 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF3P61204 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms