Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFRD-1P60508 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms