Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK4P57078 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms