Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BACE1P56817 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BACE1P56817 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BACE1P56817 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BACE1P56817 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BACE1P56817 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BACE1P56817 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BACE1P56817 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BACE1P56817 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BACE1P56817 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BACE1P56817 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BACE1P56817 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BACE1P56817 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BACE1P56817 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms