Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP9P55211 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP9P55211 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP9P55211 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP9P55211 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP9P55211 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP9P55211 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP9P55211 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP9P55211 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms