Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP7P55210 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP7P55210 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP7P55210 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP7P55210 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP7P55210 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP7P55210 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms