Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNB3P54284 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms