Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SMARCA4P51532 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms