Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TAF6P49848 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TAF6P49848 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TAF6P49848 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TAF6P49848 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF6P49848 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF6P49848 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF6P49848 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms