Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCLMP48507 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCLMP48507 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCLMP48507 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCLMP48507 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCLMP48507 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCLMP48507 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms