Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4P46934 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4P46934 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms