Protein–RNA interactions for Protein: P46108

CRK, Adapter molecule crk, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKP46108 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRKP46108 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRKP46108 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRKP46108 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRKP46108 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRKP46108 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms