Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSFMP43897 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TSFMP43897 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSFMP43897 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSFMP43897 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSFMP43897 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSFMP43897 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSFMP43897 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSFMP43897 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSFMP43897 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSFMP43897 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms