Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA4P43694 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA4P43694 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA4P43694 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA4P43694 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA4P43694 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA4P43694 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms