Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ITGAEP38570 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms