Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC1P33527 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ABCC1P33527 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms