Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPS1P31327 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPS1P31327 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPS1P31327 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CPS1P31327 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPS1P31327 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPS1P31327 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPS1P31327 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPS1P31327 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPS1P31327 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPS1P31327 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPS1P31327 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPS1P31327 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPS1P31327 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms