Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXA13P31271 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXA13P31271 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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