Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP1P30622 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms