Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLD1P28340 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLD1P28340 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLD1P28340 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLD1P28340 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLD1P28340 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLD1P28340 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLD1P28340 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLD1P28340 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms