Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PSMB9P28065 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms