Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IL3RAP26951 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IL3RAP26951 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms