Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTSSP25774 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTSSP25774 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms