Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRGP23470 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRGP23470 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRGP23470 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms