Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CXCL3P19876 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CXCL3P19876 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CXCL3P19876 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CXCL3P19876 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CXCL3P19876 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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CXCL3P19876 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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CXCL3P19876 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL3P19876 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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