Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD53P19397 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD53P19397 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD53P19397 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms