Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFAP15692 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms