Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA4P13612 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA4P13612 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 451.5 ms