Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCL2P13500 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL2P13500 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL2P13500 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL2P13500 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL2P13500 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms