Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FCER1AP12319 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms