Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RARBP10826 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RARBP10826 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RARBP10826 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RARBP10826 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RARBP10826 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms