Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms