Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UQCRFS1P1P0C7P4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UQCRFS1P1P0C7P4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms