Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXD4P09016 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXD4P09016 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms